NUEVA YORK (AP) - Para millones de personas, el árbol de Navidad es un espectáculo alegre. Para los científicos que descifrar los códigos de ADN de plantas y animales, es un monstruo.
Estamos hablando de la conífera, el término general para árboles portadores de cono, como el abeto, abeto, pino, ciprés y cedro. Además de su popularidad Yuletide, desempeñan papeles importantes en la industria de la madera y en los ecosistemas forestales sanos.
A los científicos les encanta identificar los miles de millones de bloques de construcción que conforman el ADN de una conífera. Eso se llama secuenciación de su genoma. Este tipo de análisis es una herramienta estándar de la biología, y hacerlo por coníferas podría revelar secretos genéticos útiles para la ciencia básica, el mejoramiento y la gestión forestal.
Pero el genoma de coníferas es un auténtico desafío enorme. Y como una etiqueta de precio grande en un deseo para la actualidad, que ha puesto fuera de su alcance.
Ahora, al acercarse la Navidad, parece el papel de la conífera como Grinch genética puede estar terminando.
En los últimos meses, los equipos científicos de los Estados Unidos y Canadá han dado a conocer las descripciones preliminares, desiguales de los genomas de coníferas. Y un equipo sueco tiene previsto hacer lo mismo pronto en su búsqueda de la picea de Noruega.
"El mundo cambió para conífera genética", dijo David Neale, de la Universidad de California, Davis. Se trata de "entrar en la era moderna".
¿Qué ha pasado? Crédito a los mismos avances tecnológicos recientes que tienen algunos médicos predicen que algún día, la gente tendrá sus genomas secuenciados de forma rutinaria como parte de la atención médica. La tecnología para la que se ha vuelto más rápido y mucho más barato.
"Hasta hace unos pocos años atrás, la idea de secuenciar un genoma aún conífera único que parecía imposible", dijo John MacKay, de la Universidad de Laval en Quebec, quien co-dirige un proyecto multi-institución canadiense que es la lucha contra el abeto blanco. Las nuevas tecnologías han cambiado eso, dijo.
¿Qué tan grande es un genoma conífera? Considere el árbol de Navidad de 80 pies en el Rockefeller Center de Nueva York. Se trata de un abeto rojo, por lo que su genoma es seis veces más grande que la de patinaje a nadie por debajo de él. Otros genomas de coníferas son aún mayores.
Nadie espera una perfecta y completa del genoma de coníferas en el corto plazo. MacKay y otros dicen que para alcanzar ese objetivo probablemente requeriría algunos avances en la tecnología. Pero incluso versiones parciales pueden ayudar a los criadores de árboles y científicos básicos, según los investigadores.
¿Por qué molestarse en hacer esto?
Para los criadores, "genomas realmente puede ayudar a acelerar el proceso y simplemente hacer un mejor trabajo de selección de los árboles, si se entiende la arquitectura genética de los rasgos que desea criar," dijo MacKay.
La posibilidad de que el cambio climático trae otra dimensión. Como gestores forestales seleccionar árboles para plantar después de un incendio o la tala de árboles, la información genética puede ayudarles a escoger las variedades que pueden adaptarse a las tendencias del clima en las próximas décadas, dijo Neale.
Se trata de "darles un árbol que será saludable en el futuro", dijo.
Para secuenciar un genoma, los científicos comienzan a cortar el ADN en pequeños trozos, y dejar que sus máquinas secuencia de cada bit. Esa es la parte que se ha vuelto mucho más rápido y más barato en los últimos años. Pero luego viene la tarea de volver a montar estos bits de nuevo en las largas cadenas de ADN que se encuentran en los árboles. Y eso es un reto enorme, con coníferas, debido a que sus cadenas de ADN contienen muchas secuencias repetidas que hacen que el montaje mucho más difícil.
Como resultado, las coníferas presentan "estas grandes regiones que creo que nunca será capaz de reconstruir", con las tecnologías actuales, dijo Par Ingvarsson de la Universidad de Umea en Suecia, que lidera el proyecto abeto rojo.
Se científicos a desarrollar nuevas tecnologías para superar ese problema?
"Uno nunca debe decir nunca en este juego", dijo Ingvarsson.
El verano pasado, un grupo de Neale presentó los resultados parciales de la secuencia del genoma del pino tea, con base en ADN extraído de un piñón único. Incluye aproximadamente un millón de trozos desconectados de ADN, y en conjunto se cubre más de la mitad del genoma del árbol.
Neale cifras que se llevará a su equipo hasta el año 2016 para completar el genoma de incienso, abeto Douglas y el pino de azúcar. El proyecto está financiado por el Departamento de Agricultura de EE.UU..
Grupo de Mackay publicó recientemente sus primeros resultados en el ADN tomado de un abeto blanco único.
En cuanto al proyecto sueco sobre el abeto rojo, Ingvarsson dijo que sus resultados se harán públicos el próximo año. Los 2 millones de unidades de ADN han capturado a la mayoría de los cerca de 35.000 a 40.000 genes en el árbol, aunque los investigadores no saben exactamente dónde ir esos genes en la secuencia del genoma total, dijo.
La gente tiene unos 23.000 genes, no muy diferentes de una conífera. El genoma del árbol mucho más grande, ya que también contiene una gran cantidad de no-gen de ADN sin función obvia, Ingvarsson dijo.
Dijo que su principal razón para hacer frente a los genomas de coníferas fue llenar una vacante visible en la lista de plantas secuenciadas.
"Era como si la pieza que falta",
dijo. "Sólo necesitamos esta última pieza que decir algo acerca de cómo
todo el reino vegetal ha evolucionado en los últimos mil millones de años más o
menos."
Por MALCOLM RITTER
0 comentarios:
Publicar un comentario